Be mikroskopų ir Petri lėkščių, kompiuteriai yra svarbi mikrobiologų priemonė. Mikrobiologijos tyrimų programinė įranga apima įrankius, naudojamus kitų mokslo ir inžinerijos sričių, taip pat specializuotas programas bakterijoms ir kitiems mikroorganizmams tirti. Daugelis vyriausybinių agentūrų, ne pelno fondų ar akademinių tyrėjų sukurtų programų yra nemokamos programinės įrangos, kurias galima atsisiųsti ir naudoti pagal jūsų eksperimentą ar laboratoriją.
Vizualizavimo įrankiai
Fizinis ar psichinis jūsų surinktų neapdorotų duomenų vaizdas gali padėti geriau suprasti jų kokybę, reikšmingumą ir reikšmę. Atvirojo kodo ir komercinė duomenų vizualizavimo programinė įranga yra plačiai prieinama mikrobiologijos tyrimams. Kurkite savo diagramas ir diagramas naudodami „LibreOffice Calc“, „Microsoft Excel“ ar „Mondrian“ duomenų vizualizavimo sistemą. „Cell-O“ ir „RasMol“ programos padeda sukurti 2D ir 3D animuotus biologiškai reikšmingų molekulių, tokių kaip baltymai ir amino rūgštys, modelius.
Matematinis modeliavimas
Dideli mikrobiologinių duomenų rinkiniai dažnai suteikia reikšmingesnės informacijos, kai jie yra išanalizuoti skaitmeniškai. MATLAB, „Octave“ ir „SciPy“ programinės įrangos paketai, atliekantys mokslininkų duomenų matematinį tobulinimą, analizę ir modeliavimą. Naudokite šiuos paketus, norėdami įvertinti parametrus kreivės pritaikymu, epidemiologinėmis prognozėmis, bakterijų augimo modeliavimais ir duomenų triukšmo ar stochastinio poveikio pašalinimu. Ši programa taip pat atlieka statistinius skaičiavimus, pvz., Dispersijos analizę arba Chi kvadrato testus.
Genomo bioinformatika
Mikrobiologijos programinės įrangos programos taip pat padeda vizualizuoti ir išgauti informaciją iš nukleorūgščių, sudarančių mikroorganizmo DNR, sekos. „Open Bioinformatics Foundation“ teikia nemokamas, atviro kodo DNR sekos nustatymo ir analizės programas, tokias kaip „BioJava“ ir „Biopython“, kurios išskiria duomenis iš genomo informacijos bankų, analizuoja organizmo DNR kodą ir lygina jį su kitais DNR mėginiais. Papildomus genomo analizės paketus sudaro „Emboss“, „HMMER“, „Clustal Omega“, „Phylogeny Inference Package“ arba „PHYLIP“ ir „Sequence Manipulation Suite“ arba SMS.
Pamatinė programinė įranga
Dėl greito mokslinių atradimų mikrobiologijoje tempo ir besikeičiančių vyriausybės nuostatų būtina, kad mikrobiologai galėtų lengvai naudotis informacija, kuri daro įtaką jų darbui. „HUGO“ yra komercinės programinės įrangos paketas, teikiantis mikrobiologams aktualią informaciją apie įrankius, chemikalus, įrangą, kultūros terpę, saugos reikalavimus, naujus organizmus, taksonominius pokyčius ir antibiotikus. Be to, maisto moksle dirbantys mikrobiologai gali naudotis „ComBase Browser“ žiniatinklio programa, kad pasiektų su maistu susijusius mikrobiologinius duomenis, kuriuos pateikė vyriausybinės agentūros Jungtinėje Karalystėje, Australijoje ir Jungtinėse Valstijose.
